游戏开始时玩家需要从真新镇出发，选择初始精灵妙蛙种子、小火龙或杰尼龟其中一个，随后和劲敌小茂进行第一次对战。完成基础教学后，前往常磐市商店取得大木博士的包裹并返回研究所，获取宝可梦图鉴开始冒险旅程。初期需要穿梭常磐森林前往尼比市，挑战首个道馆馆主小刚，其运用岩石系宝可梦阵型，提议优先培养草系或水系精灵应对。

通过月见山时会遭遇火箭队成员并获取化石，可选择镰刀盔或菊石兽化石其中一个。抵达华蓝市后需挑战水系馆主小霞，队伍中应有克制水属性的电系或草系宝可梦。在25号道路击败五名训练家后获取船票，这是前往枯叶市圣安奴号游轮的决定因素道具。游轮上包含多个训练师对战和隐藏道具，最终在船长室获取秘传机居合斩，用于清除挡路的小树。

枯叶市电系道馆需要解开垃圾桶机关才能挑战馆主马志士，提议携带地面系宝可梦应对其雷丘等主力。通过地鼠洞穴可返回尼比市周边区域，在紫苑镇宝可梦塔需取得观测镜才能对抗幽灵系宝可梦。彩虹市剧情涉及火箭队基地潜入，需击败地下四层的坂木老大获取决定因素道具。期间培养多属性平衡的队伍，以应对不同道馆的专精属性。

后期需唤醒挡路的卡比兽并挑战剩余道馆，最终进入石英高原挑战四天王和冠军。四天王分别擅长冰系、格斗系、毒系和龙系宝可梦，冠军小茂的队伍则包含多属性高等级宝可梦。通关后开始七岛剧情，可捕捉火焰鸟、闪电鸟等传说宝可梦。游戏隐藏要素包括未知图腾收集、训练师塔挑战和岛屿寻觅等内容。注意及时存档避免进度丢失，部分剧情道具如茶、金珠等会影响任务推进。战斗策略需注重属性克制和情形技能运用，捕捉稀有精灵时可利用睡眠或麻痹情形进步成功率。通关后仍可继续完成图鉴收集和训练师挑战，部分区域需特定秘传机技能才能进入。